Эпизод 01 - Кража Голокрона
"Извлеченный урок - это приобретенный опыт"

Премьера эпизода: 2 октября 2009
Сценарий: Paul Dini
Режиссер: Justin Ridge
Действующие лица: Кад Бейн, Асока Тано, Анакин Скайуокер, Оби-Ван Кеноби, Йокаста Ну, Като Паразитти, Тодо 360, Мейс Винду, Йода
Место действия: Фелусия, Корускант

Сюжет: Джедаи пойманы в ловушку на Фелусии! Клоны окруженны силами дроидов. Их единственная надежда - штурмовики Республики, готовые при первой возможности приземлиться на поверхности. Боевым крейсерам джедаев удалось пробить дыру в обороне дроидов и направить помощь.
Кад Бейн проникает в Храм Джедаев, чтобы попытаться украсть древний артефакт джедаев Голокрон. Асока, Анакин и Оби-Ван, пытаются помешать наемному убийце убежать с ценным артефактом джедаев.

Эпизод 02 - Корабль обречённых
"Самонадеянность - самая опасная форма небрежности"

Премьера эпизода: 2 октября 2009
Сценарий: George Krstic
Режиссер: Rob Coleman
Действующие лица: Анакин Скайуокер, Асока Тано, Кад Бейн, Болла Ропал, капитан клонов Рекс, R2-D2, адмирал Юларен, солдат-клон Денэл, Нут Ганрей
Место действия: Пространство над Деварон

Сюжет: Артефакт похищен! Наемный убийца Кад Бейн был нанят Дарт Сидиусом чтобы украсть Голокрон из хранилища Храма джедаев. Бежав с места преступления, Бэйн выслеживает и захватывает в плен магистра Болла Ропал, у которого хранится кристалл, который содержит тайны Ордена Джедаев. Флот Сепаратистов прибыл на помощь наемнику, Анакин спешит наперехват, чтобы не дать Бейну продать украденный артефакт.
Анакин и Асока перехватывают военный корабль Када Бэйна, надеясь возвратить украденный Голокрон, но джедаи недооценивают хитрую тактику наемного убийцы.

Эпизод 03 - Дети Силы
"Первый шаг к исправлению ошибки - терпение"

Премьера эпизода: 9 октября 2009
Сценарий: Henry Gilroy, Wendy Meracle
Режиссер: Brian Kalin O'Connell
Действующие лица: Кад Бейн, Оби-Ван Кеноби, Мейс Винду, Анакин Скайуокер, Асока Тано, Дарт Сидиус, Верховный канцлер Палпатин, коммандер клонов Коди, Йода
Место действия: Корусант, Родия, Набу, Мустафар

Сюжет: В погоне за вором Анакин Скайуокер вместе со своим падаваном Ахсокой высадился на корабль хитрого наемника Када Бейна, чтобы вернуть украденный Голокрон, который содержит список всех детей в Галактике способных чувствовать Силу - будущих рыцарей джедаев. После отчаянной погони и схватки со злодеем клоны, во главе с Анакином, разгромили Бейна, но им пришлось эвакуироваться с обреченного корабля без Голокрона.
Дарт Сидиус отдает новый темный приказ: похитить нескольких чувствительных к Силе детей и доставить на Мустафар.

Эпизод 04 - Шпион в Сенате
"Любящее сердце не знает сомнений"

Премьера эпизода: 16 октября 2009
Сценарий: Melinda Hsu
Режиссер: Steward Lee
Действующие лица: Падме Амидала, Анакин Скайуокер, Оби-Ван Кеноби, Мейс Винду, Йода, R2-D2, C-3PO, сенатор Раш Кловис, сенатор Лотт Дод
Место действия: Корускант, Като Неимодия

Сюжет: В Сенате предатель! Совет Джедаев подозревает, что сенатор Раш Кловис принимает участие в заговоре сепаратистов. Но чтобы узнать замыслы сенатора от Скипио Совету нужен свой собственный шпион. Тем временем, по долгу службы, джедай Анакин Скайуокер был вынужден надолго покинуть Корускант для руководства армией клонов. И вот наконец, после долгой разлуки, Анакин возвращается для долгожданного воссоединения со своей женой Падме Амидалой. По просьбе Совета Джедаев он уговаривает Падме проследить за сенатором Кловисом и расследовать сепаратистский заговор в Сенате.

Эпизод 05 - Высадка на Пойнт-Рейн
"Поверь в себя и тогда другие поверят в тебя"

Премьера эпизода: 4 ноября 2009
Сценарий: Brian Larsen
Режиссер: Brian Kalin O'Connell
Действующие лица: Анакин Скайуокер, Оби-Ван Кеноби, Ки-Ади-Мунди, Асока Тано, коммандер клонов Коди, капитан клонов Рекс, коммандер клонов Джет
Место действия: Джеонозис

Сюжет: Контратака! Пока армия клонов прочесывает галактику безуспешно пытаясь обнаружить флот генерала Гривуса, планеты сепаратистов, ранее нейтральные, восстают против Республики. На Джеонозисе лидер сепаратистов Поггль-младший, укрыв свои новые фабрики надежным силовым полем, тысячами штампует новые ужасные виды боевой техники, которые прямо с конвеера отправляются в бой. Джедаи, стремясь во чтобы то ни стало восстановить порядок в Республике, подготовили массированное вторжение, чтобы захватить Джеонозис и закрыть фабрики Поггля раз и навсегда.
Анакин, Асока и Ки-Ади-Мунди возглавляют десант для уничтожения завода по производству дроидов на Джеонозисе.